Analisi del microbioma

Caratterizzazione della diversità microbica del suolo mediante metabarcoding del DNA

Il metabarcoding del DNA è una metodologia consolidata per l’analisi della composizione dei microrganismi (batteri e funghi) che costituiscono il microbioma del suolo. Questa rilevazione sistematica consente di caratterizzare la diversità microbica e di trarre conclusioni sulle funzioni ecologiche e sui processi che avvengono nel suolo. Il metodo si basa sul sequenziamento di specifici marcatori genetici del genoma degli organismi ed è considerato una procedura standard nella moderna ricerca sul microbioma. Come materiale di partenza vengono utilizzati campioni di terra, che possono essere analizzati singolarmente o con repliche biologiche, a seconda degli obiettivi della ricerca.

L'analisi del microbioma è utile, tra l'altro, per le seguenti questioni:

  • Confronti tra siti oppure analisi prima e dopo
  • Valutazione di aree protette e superfici di riferimento, incluso il confronto con specie incluse nella Lista Rossa
  • Analisi dell’effetto di trattamenti al terreno o di cambiamenti nelle pratiche agricole
  • Confronti tra diverse pratiche agricole
  • Monitoraggio di progetti di rinaturalizzazione e rigenerazione

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Da 1212,00 €

incl. IVA al 20%

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Descrizione

Saremo lieti di pianificare insieme a te il tuo progetto e di occuparci della sua realizzazione.

I prezzi dipendono dal numero di campioni e dall'entità dell'analisi richiesta. Saremo lieti di preparare un'offerta personalizzata, una volta definiti tutti i dettagli del progetto.

Analisi solo dei funghi oppure solo dei batteri

  • Da 1 a 3 campioni: 1010,00 € per campione, IVA esclusa
  • Da 4 a 10 campioni: 410,00 € per campione, IVA esclusa
  • Da 10 campioni: 290,00 € per campione, IVA esclusa

Analisi combinata di funghi e batteri

  • Da 1 a 3 campioni: 1556,00 € per campione, IVA esclusa
  • Da 4 a 10 campioni: 656,00 € per campione, IVA esclusa
  • Da 10 campioni: 476,00 € per campione, IVA esclusa

Per gli studi comparativi si consiglia l'utilizzo di almeno tre repliche per ciascun gruppo di analisi. In aree omogenee, è possibile utilizzare anche campioni compositi come repliche. In questo caso, più campioni vengono combinati tra loro, il che aumenta la diversità rilevata, ma riduce la precisione statistica tra i campioni.

Esempio: Un'area viene campionata per tre anni consecutivi. Per il confronto statistico, sono necessarie tre repliche all'anno. In totale, risultano nove campioni.

Analisi e valutazione dei dati: A seconda degli obiettivi dello studio e del livello di approfondimento dell’analisi, possono essere previsti costi aggiuntivi per l’analisi bioinformatica e statistica dei dati. Tali costi sono generalmente compresi tra 3000,00 € e 6000,00 € IVA esclusa e, in base all'estensione dell'analisi, possono anche essere superiori.

Il costo dell'analisi dipende solo in parte dal numero di campioni. È quindi possibile raccogliere campioni provenienti da più aree o progetti e analizzarli insieme, così da ridurre il costo per singolo campione. È anche possibile effettuare un campionamento scaglionato nel tempo con un'analisi congiunta.

Offriamo consulenza per la pianificazione del progetto, il campionamento, il disegno dello studio e l’interpretazione dei risultati. Prenota ora una consulenza. Prenota ora la tua consulenza. 

Per l'analisi vengono utilizzati marcatori genetici consolidati.

  • Batteri: regione V4 del gene 16S rRNA
  • Funghi: regione ITS2

Il valore informativo dell'analisi dipende in larga misura dalla qualità del materiale campionato inviato. Una conservazione non corretta, variazioni di temperatura o contaminazioni possono compromettere l'analisi.

Il tempo di elaborazione è di massimo dieci settimane dal ricevimento del campione. I risultati vengono forniti in formato digitale tramite e-mail.